Il suggestivo rito della “Discesa della croce” si svolge in penombra, con la luce solare penetrante dalle vetrate della navata. Ispirata anticamente dai Francescani osservanti, e praticata dai fratelli laici, prevedeva la deposizione di una statua del Cristo, dotata di testa e braccia snodabili, in un lenzuolo listato a lutto, a cui seguiva la processione per le navate della chiesa e l'adorazione di Gesù Morto, l'ascolto della parola e le preghiere. La cerimonia si conclude con il bacio dei fedeli ai piedi del Cristo Morto.
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Oggi è preceduta dalla liturgia della Passione di N.S. G. C. ed accompagnata dalle meditazioni sulle 7 Parole di Cristo in croce e dai canti .